You'll understand the difference after a while
という意味だったら、「しばらく」がいいと思いますよ。
例えば、
「しばらくしたら違いがわかるようになります」
「ちょっと」と「しばらく」は同じではありません。
「しばらく」は「ちょっと」よりずっと長い時間です。
具体的な時間は場合によって違いますけれど、例えば、電話をかけたときに
「ちょっとお待ちください」と言えばすぐに相手は出てきますが（長くても１０～２０秒？）
「しばらくお待ちください」と言われたら数分は待たなくてはならないだろうなと思います。