Limiting yourself to this formation, this should work better for you:
私は多くの日本人が中国人は日本人を嫌がっていると思っていると聞いたことがある。
↑
Remember that in stacked/layered sentences, Japanese tends to follow a は/が/は/が pattern.
However, if you want a more natural way to say this:
多くの日本人は中国人が日本人を嫌がっていると思っていると私は聞いたことがある。
↑
This would lack emphasis in any particular point, but with the nouns placed closer to their respective verbs, becomes more easily understood (since this is such a convoluted sentence).